Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
TCOF1Q13428 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
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TCOF1Q13428 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
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TCOF1Q13428 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
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TCOF1Q13428 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC8□□□□□ -1.13
TCOF1Q13428 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC8□□□□□ -1.13
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