Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NME3Q13232 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NME3Q13232 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NME3Q13232 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NME3Q13232 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NME3Q13232 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NME3Q13232 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NME3Q13232 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NME3Q13232 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NME3Q13232 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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NME3Q13232 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NME3Q13232 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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NME3Q13232 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NME3Q13232 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NME3Q13232 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NME3Q13232 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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NME3Q13232 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NME3Q13232 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NME3Q13232 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NME3Q13232 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NME3Q13232 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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NME3Q13232 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NME3Q13232 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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NME3Q13232 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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NME3Q13232 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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NME3Q13232 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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NME3Q13232 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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NME3Q13232 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NME3Q13232 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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