Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
IFT88Q13099 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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IFT88Q13099 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
IFT88Q13099 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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