Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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