Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXO1Q12778 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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