Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM3AP98173 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms