Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 MEIS1-202ENST00000398506 3530 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXD8P13378 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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