Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 REG4-204ENST00000530654 612 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC110603.1-201ENST00000580645 468 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC105227.1-201ENST00000586227 438 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC008734.1-201ENST00000594006 537 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AL589765.5-201ENST00000596133 515 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 ZNF473-209ENST00000601364 603 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC005070.2-201ENST00000604391 260 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 SNORA30B-201ENST00000365319 129 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms