Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RFXAPO00287 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms