Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms