Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms