Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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C9orf40Q8IXQ3 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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C9orf40Q8IXQ3 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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C9orf40Q8IXQ3 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C9orf40Q8IXQ3 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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