Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTF1AQ7RTS3 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTF1AQ7RTS3 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms