Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AC068481.1-201ENST00000415520 530 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 ZRANB2-AS1-202ENST00000450461 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 NCKAP5-204ENST00000409213 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM208BQ5VWN6 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms