Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDLIM3Q53GG5 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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