Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TAF1AQ15573 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.1 ms