Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 PAIP2B-201ENST00000244221 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL4A6Q14031 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 232.1 ms