Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GTF2H3Q13889 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
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