Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RUNX3Q13761 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RUNX3Q13761 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
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