| RUNX3 | Q13761 | PPP3R1-203 | ENST00000409752 | 851 nt | TSL 3 BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP126-201 | ENST00000411143 | 300 nt | BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00342-201 | ENST00000412393 | 654 nt | TSL 3 BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC211486.3-201 | ENST00000412694 | 621 nt | BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL7P56-201 | ENST00000429441 | 717 nt | BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MRPS21P3-201 | ENST00000436696 | 262 nt | BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092647.3-201 | ENST00000443044 | 633 nt | BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL590764.1-201 | ENST00000450860 | 726 nt | TSL 3 BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC019117.1-204 | ENST00000451792 | 442 nt | TSL 3 BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BX546450.1-201 | ENST00000454307 | 482 nt | TSL 2 BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC013701.1-201 | ENST00000522657 | 465 nt | BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MS4A6A-210 | ENST00000529054 | 1160 nt | TSL 5 BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC024940.3-201 | ENST00000538551 | 316 nt | BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AAGAB-203 | ENST00000542650 | 1015 nt | TSL 2 BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006511.5-202 | ENST00000546339 | 1198 nt | TSL 5 BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092683.1-203 | ENST00000594050 | 654 nt | TSL 5 BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | XIST-210 | ENST00000602863 | 775 nt | TSL 3 BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR6748-201 | ENST00000610433 | 71 nt | BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Xist_exon4.1-201 | ENST00000615964 | 126 nt | BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001784.1-201 | ENST00000624107 | 428 nt | BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005154.1-203 | ENST00000626245 | 451 nt | TSL 5 BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PAK3-202 | ENST00000360648 | 2241 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006600.2-201 | ENST00000624834 | 2506 nt | BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CASC19-281 | ENST00000642118 | 1554 nt | BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EEF1A1P33-201 | ENST00000554413 | 1362 nt | BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RSF1-204 | ENST00000480887 | 5318 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00907-201 | ENST00000585627 | 3324 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZPLD1-201 | ENST00000306176 | 3619 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.53 | □□□□□ -1.52 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ALCAM-205 | ENST00000472644 | 4189 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CNOT4-205 | ENST00000423368 | 3297 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NXF3-201 | ENST00000395065 | 1938 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CCAT2-201 | ENST00000630920 | 1752 nt | BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PSD3-204 | ENST00000440756 | 11690 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCGF5-201 | ENST00000336126 | 7018 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RUFY3-201 | ENST00000226328 | 4233 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CLVS1-203 | ENST00000518592 | 2880 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC021205.3-201 | ENST00000609680 | 1709 nt | TSL 3 BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UGT2B24P-201 | ENST00000514441 | 1597 nt | BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF266-207 | ENST00000592904 | 4401 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL158152.1-201 | ENST00000602652 | 1435 nt | BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP103-201 | ENST00000363848 | 320 nt | BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-4P-201 | ENST00000364588 | 130 nt | BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU1-59P-201 | ENST00000364829 | 162 nt | BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GNG5P2-201 | ENST00000372054 | 207 nt | BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRAJ35-201 | ENST00000390502 | 59 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ESRRG-208 | ENST00000391890 | 5542 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP216-201 | ENST00000411050 | 312 nt | BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS26P13-201 | ENST00000419030 | 330 nt | BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR10T1P-201 | ENST00000424327 | 947 nt | BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SDCBP-205 | ENST00000447267 | 772 nt | TSL 3 BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IGBP1P3-201 | ENST00000447449 | 1000 nt | BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AZGP1P2-201 | ENST00000454506 | 345 nt | BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL035446.1-201 | ENST00000455011 | 453 nt | TSL 5 BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC002075.1-201 | ENST00000457396 | 676 nt | BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009127.1-201 | ENST00000467090 | 155 nt | BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090114.3-201 | ENST00000479267 | 829 nt | BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL7P40-201 | ENST00000481703 | 745 nt | BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP373-201 | ENST00000517271 | 95 nt | BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | WDYHV1-203 | ENST00000518125 | 880 nt | TSL 2 BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC083923.2-201 | ENST00000519880 | 574 nt | TSL 4 BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092490.3-201 | ENST00000545370 | 572 nt | BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC48A1-205 | ENST00000547002 | 751 nt | TSL 3 BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U1.25-201 | ENST00000614085 | 162 nt | BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U1.34-201 | ENST00000618578 | 162 nt | BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U1.31-201 | ENST00000620022 | 160 nt | BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC099494.2-201 | ENST00000623371 | 978 nt | BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073342.3-201 | ENST00000624211 | 193 nt | BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TMPRSS11BNL-202 | ENST00000510782 | 3202 nt | TSL 2 BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCGF5-205 | ENST00000614189 | 7037 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ALKBH3-AS1-201 | ENST00000499194 | 1906 nt | TSL 2 BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | INHBA-AS1-203 | ENST00000422822 | 2312 nt | TSL 2 BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | VEZF1-204 | ENST00000584396 | 2342 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01524-201 | ENST00000428009 | 4390 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007402.1-201 | ENST00000440698 | 3939 nt | TSL 2 BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LRRC8B-201 | ENST00000330947 | 7593 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EXOC1-201 | ENST00000346134 | 3357 nt | APPRIS P4 TSL 2 BASIC | 5.52 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR2AG1-202 | ENST00000641258 | 6993 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EPHA4-202 | ENST00000409854 | 3454 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KCNQ3-205 | ENST00000621976 | 10659 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPE65-201 | ENST00000262340 | 2610 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF788-203 | ENST00000430298 | 3941 nt | TSL 2 BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MUC17-201 | ENST00000306151 | 14247 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL360270.2-201 | ENST00000562952 | 5985 nt | BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BRCA1-203 | ENST00000357654 | 7094 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF280B-201 | ENST00000613655 | 3714 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR105-1-201 | ENST00000385222 | 81 nt | BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HSPA8P15-201 | ENST00000401676 | 786 nt | BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.625-201 | ENST00000411256 | 107 nt | BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01359-201 | ENST00000415842 | 1157 nt | TSL 2 BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL691447.1-201 | ENST00000419456 | 387 nt | BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DNAJB5P1-201 | ENST00000454004 | 806 nt | BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Z92846.1-201 | ENST00000456203 | 268 nt | BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011287.2-201 | ENST00000456809 | 842 nt | TSL 5 BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092754.1-201 | ENST00000472975 | 479 nt | BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC110775.1-201 | ENST00000513721 | 462 nt | BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001922.4-201 | ENST00000526967 | 290 nt | BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | YWHABP2-201 | ENST00000540201 | 713 nt | BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011447.4-201 | ENST00000587562 | 111 nt | BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL034374.2-201 | ENST00000605281 | 548 nt | BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP003789.1-201 | ENST00000617737 | 605 nt | BASIC | 5.51 | □□□□□ -1.53 | | |