Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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CDH18Q13634 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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CDH18Q13634 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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CDH18Q13634 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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CDH18Q13634 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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