Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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CUL3Q13618 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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CUL3Q13618 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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CUL3Q13618 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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CUL3Q13618 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CUL3Q13618 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CUL3Q13618 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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