Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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TCIRG1Q13488 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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TCIRG1Q13488 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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TCIRG1Q13488 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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TCIRG1Q13488 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
TCIRG1Q13488 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
TCIRG1Q13488 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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