Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ITGB3BPQ13352 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGB3BPQ13352 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms