Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
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