Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SRSF5Q13243 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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