Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHAF1BQ13112 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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