Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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