Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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FOXD4Q12950 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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FOXD4Q12950 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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