Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms