Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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PGGT1BP53609 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PGGT1BP53609 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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