Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TTPAP49638 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TTPAP49638 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TTPAP49638 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms