Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXC13P31276 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms