Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 CDY2B-202ENST00000544303 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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ECM1Q16610 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
ECM1Q16610 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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