Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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BRD3Q15059 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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BRD3Q15059 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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BRD3Q15059 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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BRD3Q15059 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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BRD3Q15059 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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BRD3Q15059 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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BRD3Q15059 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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BRD3Q15059 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
BRD3Q15059 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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