Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL591222.2-201ENST00000604443 754 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MIR6829-201ENST00000620375 67 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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