Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SSPNQ14714 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms