Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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CUL4AQ13619 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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CUL4AQ13619 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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CUL4AQ13619 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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CUL4AQ13619 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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CUL4AQ13619 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CUL4AQ13619 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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