Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CUL1Q13616 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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CUL1Q13616 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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CUL1Q13616 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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CUL1Q13616 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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CUL1Q13616 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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CUL1Q13616 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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CUL1Q13616 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CUL1Q13616 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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