Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CHAF1AQ13111 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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