Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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FOXD4Q12950 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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FOXD4Q12950 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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FOXD4Q12950 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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FOXD4Q12950 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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FOXD4Q12950 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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FOXD4Q12950 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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FOXD4Q12950 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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FOXD4Q12950 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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