Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 TCF7-202ENST00000378560 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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FOXC1Q12948 AC104066.2-201ENST00000564513 1741 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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FOXC1Q12948 CENPL-203ENST00000367710 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
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FOXC1Q12948 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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FOXC1Q12948 STPG1-203ENST00000374409 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 ERCC6-201ENST00000355832 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 NSRP1-217ENST00000612959 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
FOXC1Q12948 CYFIP2-221ENST00000618329 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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