Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CENPFP49454 SPATA31D4-201ENST00000419782 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CENPFP49454 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CENPFP49454 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CENPFP49454 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CENPFP49454 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CENPFP49454 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CENPFP49454 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CENPFP49454 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CENPFP49454 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AC023283.1-201ENST00000453491 4897 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CENPFP49454 UTY-205ENST00000382896 6661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CENPFP49454 UTY-211ENST00000540140 6652 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CENPFP49454 UTY-214ENST00000617789 6682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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CENPFP49454 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CENPFP49454 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CENPFP49454 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CENPFP49454 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CENPFP49454 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CENPFP49454 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CENPFP49454 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CENPFP49454 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CENPFP49454 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CENPFP49454 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CENPFP49454 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CENPFP49454 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CENPFP49454 SSPO-201ENST00000378016 15589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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CENPFP49454 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CENPFP49454 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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CENPFP49454 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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CENPFP49454 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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CENPFP49454 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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CENPFP49454 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CENPFP49454 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CENPFP49454 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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CENPFP49454 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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CENPFP49454 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CENPFP49454 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CENPFP49454 ZNF207-207ENST00000577908 4672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CENPFP49454 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CENPFP49454 NSD2-207ENST00000398261 8390 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CENPFP49454 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CENPFP49454 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CENPFP49454 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CENPFP49454 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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