Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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CASQ1P31415 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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CASQ1P31415 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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CASQ1P31415 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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CASQ1P31415 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CASQ1P31415 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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