Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HLA-DMAP28067 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms