Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 CCDC196-207ENST00000636229 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 5_8S_rRNA.6-201ENST00000637374 152 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 PDE4D-210ENST00000503258 2860 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 LRP12-201ENST00000276654 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 HESX1-201ENST00000295934 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 RAN-201ENST00000392367 780 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 TXNDC9-202ENST00000409434 1111 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 RPSAP48-201ENST00000466509 889 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 CLDND1-205ENST00000502288 560 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AP002026.1-204ENST00000506454 749 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 CC2D2A-207ENST00000507954 548 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC022639.1-202ENST00000524360 581 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 OR4N2-203ENST00000557677 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
VPREB1P12018 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms