Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MAP3K4Q9Y6R4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MAP3K4Q9Y6R4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms