Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms