Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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SNX13Q9Y5W8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
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SNX13Q9Y5W8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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SNX13Q9Y5W8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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SNX13Q9Y5W8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX13Q9Y5W8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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