Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTDP1Q9Y5B0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTDP1Q9Y5B0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms