Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
WASHC2CQ9Y4E1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
WASHC2CQ9Y4E1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
WASHC2CQ9Y4E1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
WASHC2CQ9Y4E1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms